По благословению Его Высокопреосвященства Высокопреосвященнейшего Владимира, митрополита Санкт-Петербургского и Ладожского, в 1998 году была создана православная община, которая была зарегистрирована как Православная местная религиозная организация Приход церкви святого праведного Иоанна Кронштадтского на Кронштадтской площади Санкт-Петербургской Епархии Русской Православной Церкви (Московский Патриархат). В апреле 1998 года была произведена закладка и начато строительство храма святого праведного Иоанна Кронштадтского. Чин закладки совершил благочинный Невского благочиннического округа протоиерей Виктор Голубев.
03 сентября 2004 года Указом митрополита Санкт-Петербургского и Ладожского Владимира назначен на должность настоятеля и председателя Приходского совета храма святого праведного Иоанна Кронштадтского протоиерей Михаил Подолей. С этого времени стали совершаться регулярные богослужения. Храм открыт ежедневно с 9.00 до 19.00. Храм освящен иерейским чином 21 декабря 2004 года благочинным Невского округа протоиереем Виктором Голубевым. Участвовали в освящении: протоиерей Александр Кудряшов. протоиерей Александр Захаров, иерей Димитрий Кулигин и настоятель храма протоиерей Михаил Подолей.